Công ty tôi thành lập 2014 kê khai thuế GTGT trực tiếp trên doanh thu, hoạt động 3 ngành nghề: (Giám sát thi công XD công trình, xây dựng cơ sở hạ tấng có bao thầu nguyên VL, đo đạc bản đồ) theo Bảng danh mục ngành nghề tính thuế GTGT theo tỷ lệ % trên doanh thu điều 13, thông tư 219/2013 thì Dịch vụ tư vấn giám sát thi công xây dựng cơ bản mức thuế 5%; xây dựng có bao thầu nguyên vật liệu: 3%; Hoạt động kinh doanh khác 2% (đo đạc bản đồ là hoạ động khác sẽ áp 2%)

Trong hoạt động kinh doanh công ty đã xác định và hạch toán được doanh thu từng hoạt động Giám sát, xây dưng, đo đạc bản đồ, nhưng do Công ty mới thành lập chưa nắm được đầy đủ pháp luật thuế, khi kê khai được cơ quan thuế huyện hướng dấn (Bàng lời) kê khai chung mức thuế GTGT mức 3%; 

Nay Cục thuế tỉnh kiểm tra thuế 5% với lý do khi kê khai công ty đã kê khai chung mức 3% là chưa đúng; công ty đã xuất trình được hợp đồng, nghiệm thu, quyết toán, và xác định được doanh thu từng hoạt động nhưng cục thuế không chấp nhận với lý do theo hướng dẫn điều 12 thông tư 219: Cơ sở kinh doanh nhiều ngành nghề có mức tỷ lệ khác nhau phải khai thuế GTGT theo từng nhóm ngành nghề tương ứng với các mức tỷ lệ theo quy định; trường hợp người nộp thuế không xác định được doanh thu theo từng nhóm ngành nghề hoặc trong một hợp đồng kinh doanh trọn gói bao gồm các hoạt động tại nhiều nhóm tỷ lệ khác nhau mà không tách được thì sẽ áp dụng mức tỷ lệ cao nhất của nhóm ngành nghề mà cơ sở sản xuất, kinh doanh.

Mặc dù Công ty đã giải trình và đề nghị cục thuê xác định từng hoạt động theo quy định để tính thuế, công ty chấp nhận hoạt động giám sát kê khai 3% là chưa đúng chụi trách nhiệm nộp phát và nộp chậm còn hoạt động xây dựng có bao thầu vật liệu 3%, hoạt động đo đạc 2%, nhưng cục thuế không chấp nhận yêu cầu tính tất cả 3 hoạt động trên tính thuấ 5%;

Như vậy cục thuế áp đặt có phù hợp quy định pháp luật và tình hình thực tiễn không;

Xin Luật sư tư vấn để Công ty có hướng giải quyết./.