Hàng tháng, khi doanh nghiệp đóng Bảo hiểm xã hội bắt buộc cho người lao động thì đồng thời cũng phải đóng kinh phí Công đoàn. Đây là nghĩa vụ của doanh nghiệp, không phân biệt là doanh nghiệp đã có hay chưa có tổ chức Công đoàn.

Mức đóng kinh phí Công đoàn là 2% của quỹ tiền lương làm căn cứ đóng Bảo hiểm xã hội cho người lao động. Quỹ tiền lương này là bằng tổng mức tiền lương tính đóng Bảo hiểm xã hội của những người lao động thuộc đối tượng tham gia Bảo hiểm xã hội bắt buộc.

Công đoàn cơ sở được sử dụng theo tỷ lệ phần trăm trên tổng số thu kinh phí công đoàn và tổng số thu đoàn phí công đoàn theo hướng dẫn hàng năm của Đoàn Chủ tịch Tổng Liên đoàn.

Kinh phí công đoàn và tổng số thu đoàn phí công đoàn được phân phối như sau:

- Kinh phí công đoàn (Do doanh nghiệp đóng):

2% của quỹ tiền lương làm căn cứ đóng Bảo hiểm xã hội cho người lao động.

+ Có tổ chức Công đoàn: trong đó, - Công đoàn cơ sở được sử dụng 69% tổng số thu kinh phí công đoàn và nộp 31% tổng số thu kinh phí công đoàn cho công đoàn cấp trên.

+ Không có tổ chức công đoàn: nộp 100% kinh phí công đoàn cho Công đoàn cấp trên. Doanh nghiệp không được sử dụng.

- Đoàn phí công đoàn (Do đoàn viên công đoàn đóng):

+ Có tổ chức Công đoàn: NLĐ tham gia công đoàn: đóng 1% tiền lương làm căn cứ đóng bảo hiểm xã hội, nhưng mức đóng đoàn phí hàng tháng tối đa chỉ bằng 10% mức lương cơ sở. 

+ NLĐ không tham gia công đoàn không phải đóng đoàn phí công đoàn.