Chào bạn,
Theo quy định tại Điều 22 Nghị định 48/2010/NĐ-CP quy định về hợp đồng trong lĩnh vực xây dựng (áp dụng cho trường hợp 30% vốn NN trở lên và các trường hợp khác có viện dẫn áp dụng) thì:
"Điều 22. Thanh lý hợp đồng xây dựng
1. Hợp đồng xây dựng được thanh lý trong trường hợp:
a) Các bên hoàn thành các nghĩa vụ theo hợp đồng đã ký;
b) Hợp đồng xây dựng bị chấm dứt (hủy bỏ) theo quy định của pháp luật.
2. Việc thanh lý hợp đồng phải được hoàn tất trong thời hạn bốn mươi lăm (45) ngày kể từ ngày các bên tham gia hợp đồng hoàn thành các nghĩa vụ theo hợp đồng hoặc hợp đồng bị chấm dứt (hủy bỏ) theo điểm b khoản 1 Điều này; đối với những hợp đồng có quy mô lớn thì việc thanh lý hợp đồng được thực hiện trong thời hạn không quá chín mươi (90) ngày."
Như vậy bên thầu chưa hoàn tất nghĩa vụ bảo hành thì chưa nên ký thanh lý, vì sẽ thiếu chứng cứ viện dẫn nếu có sự kiện bảo hành hoặc có tranh chấp.
Tuy nhiên, trên thực tế có nhiều DN cứ thanh lý và có điều khoản như bạn nói, và theo tôi thì chưa phù hợp.