Đối với hàng hóa, dịch vụ mua trả chậm, trả góp có giá trị trên 20 triệu đồng, cơ sở kinh doanh căn cứ vào hợp đồng mua hàng hóa, dịch vụ, hóa đơn giá trị gia tăng và chứng từ thanh toán qua ngân hàng của hàng hóa, dịch vụ mua trả chậm, trả góp để kê khai, khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào.

Trường hợp chưa có chứng từ thanh toán qua ngân hàng do chưa đến thời điểm thanh toán theo hợp đồng thì cơ sở kinh doanh vẫn được kê khai, khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào.

Đến thời điểm thanh toán theo hợp đồng nếu không có chứng từ thanh toán qua ngân hàng thì không được khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào, cơ sở kinh doanh phải kê khai, điều chỉnh lại số thuế giá trị gia tăng đầu vào đã khấu trừ.

Tôi hiện nay làm trong một doanh nghiệp vận tải biển thường xuyên phải làm các Hợp đồng kinh tế. Khi ký hợp đồng kinh tế có điều khoản bên A (người thuê vận chuyển) thanh toán tiền cước vận chuyển trong tháng này cho bên B (người vận chuyển - Công ty tôi) vào ngày 5 của tháng sau.

Tuy nhiên có nhiều trường hợp bên A thanh toán cho bên B chậm hơn thời hạn thanh toán ghi trong hợp đồng. Vậy trong trường hợp này bên A sẽ không được khấu trừ thuế GTGT đầu vào đúng không? Nếu vậy bên B có ảnh hưởng gì và trong hợp đồng kinh tế nên quy định thời hạn thanh toán thế nào cho hợp lý?

Tôi xin chân thành cảm ơn!