Mọi người ai làm hoàn thuế GTGT hàng xuất khẩu chắc cũng rõ công văn 14320 đúng không ạ.

http://www.gdt.gov.vn/wps/wcm/connect/1720f969-2656-42b5-a622-301eb367897e/CV+14320+BTC+TCT+ngay+19+10+2012.pdf?MOD=AJPERES&CACHEID=1720f969-2656-42b5-a622-301eb367897e

Trước khi CV này ra thì trong Thông tư 06 cũng nói về phần này rồi, chẳng hiểu sao xuống dưới các DN và Cục Thuế áp dụng tùm lum nên lại ra thêm CV hướng dẫn chi tiết.
Nhưng mình đọc cái CV này thì thấy không hợp lý (cũng như TT 06 và 65).
Đó là đối với DN có cả hoạt động xuất khẩu và bán trong nước, muốn tính thuế GTGT đầu vào của hàng xuất khẩu thì phải lấy Tổng thuế đầu ra trong kỳ - Tổng thuế đầu vào trong kỳ, ra được 1 con số âm (để biết còn được khấu trừ). Rồi mới lấy số này nhân với tỉ lệ Doanh thu xuất khẩu để ra thuế Xuất khẩu được khấu trừ. Ở đây mình đang giả định thuế GTGT được khấu trừ kỳ trước bằng 0 nhé.
Nhưng làm vậy ko đúng, bởi vì thực tế hàng xuất khẩu thì thuế đầu ra bằng 0 rồi, như vậy toàn bộ thuế đầu ra là của hoạt động bán trong nước, do đó chỉ được bù trừ với thuế đầu vào của hàng trong nước thôi, trong khi ở đây bù trừ với Tổng thuế đầu vào cả trong nước và Xuất khẩu.
Nếu vậy, tính thuế GTGT đầu vào của Hàng xuất khẩu phải bằng Tổng thuế đầu vào x Tỷ lệ Doanh thu xuất khẩu luôn mới đúng, chứ không phải sau khi trừ với Thuế đầu ra, vì thực tế thuế đầu ra này ko liên quan tới Thuế đầu vào của hàng xuất khẩu.
Mọi người thấy có đúng không ạ?