Căn cứ điểm d khoản 2 Điều 42 Luật Bảo vệ môi trường 2020 quy định:

"Điều 42. Căn cứ và thời điểm cấp giấy phép môi trường

...

2. Thời điểm cấp giấy phép môi trường được quy định như sau:

a) Dự án đầu tư thuộc đối tượng phải thực hiện đánh giá tác động môi trường phải có giấy phép môi trường trước khi vận hành thử nghiệm công trình xử lý chất thải, trừ trường hợp quy định tại điểm c khoản này;

b) Dự án đầu tư không thuộc đối tượng phải thực hiện đánh giá tác động môi trường phải có giấy phép môi trường trước khi được cơ quan nhà nước có thẩm quyền ban hành văn bản quy định tại các điểm a, b, c, d và g khoản 1 Điều 36 của Luật này. Trường hợp dự án đầu tư xây dựng không thuộc đối tượng được cơ quan chuyên môn về xây dựng thẩm định báo cáo nghiên cứu khả thi theo quy định của pháp luật về xây dựng thì phải có giấy phép môi trường trước khi được cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp, điều chỉnh giấy phép xây dựng;

c) Đối với dự án đầu tư quy định tại khoản 2 Điều 39 của Luật này đang vận hành thử nghiệm công trình xử lý chất thải theo quy định của pháp luật trước ngày Luật này có hiệu lực thi hành, chủ dự án đầu tư được lựa chọn tiếp tục vận hành thử nghiệm để được cấp giấy phép môi trường sau khi kết thúc vận hành thử nghiệm công trình xử lý chất thải hoặc lập hồ sơ để được cấp giấy phép môi trường trước khi hết thời hạn vận hành thử nghiệm. Chủ dự án đầu tư không phải vận hành thử nghiệm lại công trình xử lý chất thải nhưng kết quả hoàn thành việc vận hành thử nghiệm phải được báo cáo, đánh giá theo quy định tại Điều 46 của Luật này;

d) Cơ sở sản xuất, kinh doanh, dịch vụ, khu sản xuất, kinh doanh, dịch vụ tập trung, cụm công nghiệp quy định tại khoản 2 Điều 39 của Luật này đã đi vào vận hành chính thức trước ngày Luật này có hiệu lực thi hành phải có giấy phép môi trường trong thời hạn 36 tháng kể từ ngày Luật này có hiệu lực thi hành, trừ trường hợp đã được cơ quan có thẩm quyền cấp giấy xác nhận hoàn thành công trình bảo vệ môi trường, giấy chứng nhận đạt tiêu chuẩn môi trường, giấy xác nhận đủ điều kiện về bảo vệ môi trường trong nhập khẩu phế liệu từ nước ngoài làm nguyên liệu sản xuất, giấy phép xử lý chất thải nguy hại, giấy phép xả nước thải vào nguồn nước, giấy phép xả nước thải vào công trình thủy lợi (sau đây gọi chung là giấy phép môi trường thành phần). Giấy phép môi trường thành phần được tiếp tục sử dụng như giấy phép môi trường đến hết thời hạn của giấy phép môi trường thành phần hoặc được tiếp tục sử dụng trong thời hạn 05 năm kể từ ngày Luật này có hiệu lực thi hành trong trường hợp giấy phép môi trường thành phần không xác định thời hạn.

..."

=>>Theo quy định trên thì thời điểm cấp giấy phép môi trường được chia thành 4 trường hợp:

Trường hợp thứ nhất: Doanh nghiệp thực hiện dự án đầu tư đã có báo cáo đánh giá tác động môi trường (ĐTM) thì thời điểm xin cấp giấy phép môi trường như sau:

- Giấy phép môi trường phải được cấp trước khi doanh nghiệp có dự án đầu tư vận hành thử nghiệm công trình xử lý chất thải.

- Trường hợp dự án đầu tư đang vận hành thử nghiệm công trình xử lý chất thải theo quy định của pháp luật trước ngày 01/01/2022 thì doanh nghiệp có dự án đầu tư được quyền lựa chọn 1 trong 2 cách sau:

+ Thời điểm cấp giấy phép môi trường là sau khi dự án đầu tư kết thúc vận hành thử nghiệm công trình xử lý chất thải. hoặc doanh nghiệp lập hồ sơ để được cấp giấy phép môi trường trước khi hết thời hạn vận hành thử nghiệm.

+ Doanh nghiệp có thể lập hồ sơ cấp giấy phép môi trường trước khi hết hạn vận hành thử nghiệp công trình xử lý chất thải, tuy nhiên phải thực hiện báo cáo, đánh giá kết quả hoàn thành việc vận hành thử nghiệm (Báo cáo, đánh giá thực hiện theo Điều 46 Luật Bảo vệ môi trường 2020).

Trường hợp thứ hai: Dự án đầu tư của doanh nghiệp không thuộc đối tượng phải đánh giá tác động môi trường theo quy định tại Luật Bảo vệ môi trường 2020 (Đối tượng đánh giá tác động môi trường được quy định tại Điều 30 Luật Bảo vệ môi trường 2020) thì giấy phép môi trường phải được cấp trước khi cơ quan nhà nước ban hành văn bản quy định tại điểm a, b, c, d và g khoản 1 Điều 36 của Luật Bảo vệ môi trường 2020.

Trường hợp thứ ba: Trường hợp dự án đầu tư xây dựng không thuộc đối tượng được cơ quan chuyên môn về xây dựng thẩm định báo cáo nghiên cứu khả thi theo quy định của pháp luật về xây dựng (khoản 13 Điều 1 Luật Xây dựng sửa đổi 2020) thì phải có giấy phép môi trường trước khi được cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp, điều chỉnh giấy phép xây dựng.

Trường hợp thứ tư: Nếu doanh nghiệp rơi vào trường hợp quy định tại điểm d điều trên thì trong thời hạn 36 tháng tính từ ngày 01/01/2022 doanh nghiệp phải thực hiện xin cấp giấy phép môi trường.