Căn cứ khoản 1, Điều 14,  Thông tư 219/2013/TT-BTC quy định về nguyên tắc khấu trừ thuế GTGT đầu vào:

"Điều 14. Nguyên tắc khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào

1. Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ dùng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT được khấu trừ toàn bộ, kể cả thuế GTGT đầu vào không được bồi thường của hàng hóa chịu thuế GTGT bị tổn thất."

Theo đó, hóa đơn giá trị gia tăng đầu vào của các quỹ (phúc lợi, phát triển hoạt động sự nghiêp, ...) không dùng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ, do đó, chỉ có thể đưa vào chi phí được trừ khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp chứ không được khấu trừ thuế GTGT.